Основные события связаны с различными испытаниями и тренировками, которые дает дон Хуан. Карлос изучает особые практики, включая способности видеть и воспринимать то, что обычно скрыто от обычного зрения. Его обучение сопровождается сложностями, в том числе борьбой со страхами и неопределённостью. Иногда Карлосу приходится применять знания в экстремальных условиях и доверять необычным советам, полученным в особом состоянии сознания. Он овладевает техниками общения с природными элементами и использованием растительных средств, которые придают силы и помогают достигать новых состояний осознания.

В процессе обучения возникают конфликты, главным из которых является борьба с четырьмя внутренними врагами, в том числе со страхом, который мешает продолжать путь знания. Карлос проходит через моменты сомнений и ощущения утраты своего привычного тела и восприятия. Эти трудности требуют от него решимости и веры в процесс, а также способности принимать новые реалии, не опираясь на прежние представления. Дон Хуан не дает прямых ответов на многие вопросы и предостерегает Карлоса от попыток предсказать исход его пути, подчеркивая, что становление человеком знания — непредсказуемый и временный процесс.

Главной проблемой для главного героя становится необходимость изменить свое восприятие и мышление, отказаться от привычных ограничений, чтобы понять более глубокие уровни существования. Карлосу приходится принимать неожиданные советы и следовать указаниям дон Хуана и других наставников без полного понимания их смысла. Обучение требует терпения и готовности к переменам в сознании и образе жизни.

Завершается повествование этапами, в которых Карлос испытывает новые состояния, связанные с изменением восприятия мира, и возвращается к обычной жизни с приобретенным опытом. Основная тема книг — путь познания и трансформации личности через освоение традиционных знаний и практик индейского племени яки, а также борьба с внутренними ограничениями и страхами. В конечном итоге главный герой остается на пути обучения, получая силу и умение, которые позволяют ему смотреть на мир иначе.