Одним из важных моментов становится информация о кристалле, представляющем собой часть двигателя космического корабля. Прохор узнаёт, что этот артефакт мог оказаться в руках местных тунгусов много веков назад из-за временных разломов. Артефакт вызывает интерес у различных участников конфликта и служит причиной нападений со стороны агрессивных существ и других групп. В ходе исследования герой встречает сталкеров, которые столкнулись с плазмоидами и загадочными призраками, что усложняет ситуацию.

Прохор проводит время в лагере, получает поддержку от Танкиста — бармена и лидера одной из групп сталкеров, который рассказывает о событиях и помогает ориентироваться в местных условиях. Вместе с ним и другими спутниками Прохор участвует в вылазках на болота и пытается выяснить причины появления аномалий и связь этих явлений с катастрофой.

Важной частью истории становятся шаманские обряды, которые проводятся местным шаманом для взаимодействия с духами и верхним миром. Эти ритуалы оказывают влияние на происходящее и добавляют мистический элемент в научно-фантастический контекст. Герою приходится учитывать и эти аспекты при построении своих выводов и принятии решений.

Основные проблемы, с которыми сталкивается Прохор, связаны с непростыми условиями выживания в аномальной зоне, конфликтами между сталкерами, неизвестными явлениями и поиском правды о катастрофе. Он принимает решения о сотрудничестве с разными персонажами, участии в экспедициях и попытках использовать полученную информацию для продвижения в расследовании.

В ходе сюжета Прохор оказывается в ситуации, где нужно выбирать между безопасностью и необходимостью продвигаться дальше, сталкиваться с опасностями и раскрывать тайны. Исследование Тунгусской катастрофы становится не только научной задачей, но и испытанием на умение выживать в сложной обстановке и работать с различными людьми и силами в регионе.

В общей сложности «Тунгус» представляет собой повествование о человеке, который пытается понять необъяснимые явления и разгадать секреты прошлого, одновременно сталкиваясь с реальными угрозами и конфликтами современности. Сюжет разворачивается в условиях враждующих группировок сталкеров и аномалий, что формирует основное поле действий главного героя и влияет на ход расследования.