В процессе работы Дмитрий обращается к своим коллегам и знакомым, в том числе к специалисту из библиотеки Ватикана, который помогает ему сопоставить увиденное с содержанием средневековых манускриптов и бестиариев. Одновременно с этим главный герой пытается разобраться в связи между загадочной надписью, картинами и историей, окружающей их музей. Он исследует источники древних текстов, сопоставляет факты и пытается понять, какую информацию скрывает этот код.

Одновременно с основной историей раскрываются подробности, связанные с обстановкой в музее и отношениями персонажей, в том числе с сотрудниками музея и хранителями. Внимание уделяется и описанию картины Леонардо да Винчи, которая вызывает тревогу у работников из-за странного изображения, находящегося на ней. Это изображение представляет собой нечто необычное и страшное, что заставляет хранителей принимать меры для того, чтобы скрыть его от посетителей.

Главный конфликт разворачивается вокруг поиска смысла таинственной надписи и связи её с картиной. Дмитрий сталкивается с необходимостью разгадать шифр и разобраться, что именно пытался донести автор послания. Для этого ему приходится опираться на свой профессиональный опыт реставратора, общаться со специалистами по древним текстам и использовать научные методы.

В процессе расследования возникают вопросы доверия и подозрений относительно того, кто мог оставлять надписи и зачем. Это заставляет героя быть осторожным и принимать решения, способствующие сохранению музейных экспонатов и одновременно раскрытию тайны. Дмитрий старается не втягивать в свои поиски близких ему людей, чтобы не создавать им опасности.

В заключительной части книги внимание акцентируется на значении этой загадочной надписи и ее влиянии на дальнейшие события в музее. Решение, которое принимает реставратор, связано с возможностью раскрыть тайны, связанные с творчеством Леонардо да Винчи, и понять, какую роль в этом играет найденный код. Таким образом, сюжет строится вокруг взаимодействия между историей искусства, научными исследованиями и личными переживаниями главного героя, находящегося в центре необычных событий.