В процессе расследования он сталкивается с проблемой отсутствия подтверждения своей идентичности и с тем, что люди, которые должны его знать, его не узнают. Он прибегает к разным способам поиска информации, включая проверку телефонных справочников и попытки выхода на контакт с знакомыми из прошлого. Однако попытки построить логическую картину оказываются безуспешными, а ситуация принимает характер всеобъемлющей загадки.

По мере развития событий Джейсон сталкивается с внутренними и внешними препятствиями. Он испытывает физические и психологические трудности, связанные с попытками вернуть свою прежнюю жизнь и восстановить связь с реальностью. Ему приходится справляться с сомнениями в собственной адекватности и бороться с ощущением одиночества и утраты. Ключевой проблемой становится поиск ответа на вопрос о том, как именно его реальность была изменена и возможно ли вернуться к прежнему состоянию.

Главный герой принимает решение не сдаваться и продолжить попытки понять происходящее. Он сфокусирован на том, чтобы определить главную задачу и решить ее поэтапно, разбивая сложную проблему на более простые вопросы. Одновременно с этим Джейсон ощущает давление неизвестности и необходимость справляться с её последствиями.

В книге показано, как Джейсон пытается сохранить связь с реальным миром, опираясь на мелкие вещи и воспоминания, хотя они постепенно теряют четкость. Его действия приводят к развитию понимания того, что для выхода из сложившейся ситуации требуется глубокое осознание своей идентичности и принятие трудных решений.

Темная материя затрагивает тему выбора между различными вариантами существования и исследует последствия столкновения с измененной реальностью. В конце повествования остаётся центральный вопрос: как сохранить себя в условиях, когда привычный мир исчезает, и каким образом найти опору в жизни, которая подверглась радикальным изменениям.