Основной конфликт возникает из-за сокровищ и событий, связанных с ними. Смолл описывает условия, при которых он готов делиться найденными ценностями, в частности, своё требование о свободе для себя и своих друзей. Он также рассказывает о сложностях с побегом, связанных с отсутствием подходящей лодки и достаточного запаса пищи. В дело вмешиваются различные заинтересованные стороны, в том числе майор и капитан Морстен, которые обсуждают возможность транспортировки лодки для осуществления побега против воли властей.

В ходе развития сюжета Холмс анализирует заметки и письма, пытается понять, кто стоит за сообщениями и какие цели преследуют все участники. Доктор Ватсон наблюдает за ходом размышлений Холмса и за атмосферой, связанной с этим делом, отмечая, что ситуация вызывает напряжение у всех, кроме самого Холмса, который продолжает работать над раскрытием загадки. Важными элементами расследования становятся детали, связанные с почерком и доказательствами, найденными в записных книжках и письмах.

В конечном итоге внимание сосредоточено на том, какие действия необходимо предпринять, чтобы разрешить проблему с сокровищами и чтобы освободить Джонатана Смолла и его товарищей. В центре остается вопрос о том, как соотнести личные интересы и общественную справедливость в сложившейся ситуации. Рассказ завершает акцент на необходимости принятия решений, которые повлияют на будущее всех участников дела.