В процессе развития сюжета Алёна сталкивается с различными сложностями, включая напряжённые отношения с одноклассниками и преподавателями, а также внутренние сомнения и страхи. Она пытается понять, что происходит вокруг, и разобраться в тайнах, которые скрывают озёра-близнецы. Алёна получает помощь от нескольких знакомых, в том числе от своей тёти Марты и друга Димки, но многое ей приходится делать самостоятельно. Она исследует архивы, изучает старые документы и пытается найти связь между исчезновением и мистическими явлениями, происходящими в городе и школе.

Главным конфликтом является борьба героини с непонятными и опасными событиями, которые угрожают не только ей, но и окружающим. Она сталкивается с необходимостью выбирать между тем, чтобы оставаться в стороне и не вмешиваться, или активно участвовать в расследовании и пытаться раскрыть правду. Дополнительной проблемой становится напряжённая обстановка в школе, где возникают разногласия и недоверие между учениками и преподавателями из-за произошедших событий.

В ходе сюжета Алёна постепенно собирает информацию, которая помогает ей приблизиться к разгадке. Она пытается понять, как устроен мир ведьм, в котором ей приходится жить, а также как связаны личные проблемы и общие угрозы для школы. Её опыт и знания расширяются, но вместе с тем растёт и напряжение. Она учится принимать сложные решения, ориентируясь на имеющиеся данные и собственные ощущения.

В финальной части истории внимание сосредоточено на результатах выбора Алёны и её готовности столкнуться с последствиями. Главной темой остаётся поиск истины и умение делать выбор в сложных условиях. Книга раскрывает, как героиня развивается и меняется под воздействием внешних обстоятельств и внутренних переживаний, находясь в мире, где реальность и магия тесно переплелись.