Главный конфликт разворачивается вокруг авторитета вождя и отношения племени к переменам и новым идеям. Когда наступает похолодание и неурожай, а добыча становится мало, Миау предлагает объявить забастовку охотников с требованием теплой одежды и улучшения условий. Вождь Хряп отказывается и не предпринимает никаких мер, что приводит к ухудшению ситуации в племени. Когда ситуация становится критической, Хряпа случайно травмирует носорог, и вождём становится Миау.

После смены вождя условия меняются к лучшему: климат стабилизируется, животные возвращаются, и племя оживает. При этом возникшая забастовка становится первым зафиксированным случаем коллективного протеста в истории человечества. Миау, став вождём, сталкивается с новыми задачами в управлении племенем и поддержании изменений.

Основной темой книги является взаимодействие традиций и нововведений в жизни древнего общества. Через персонажей и их решения показывается, как новые идеи могут вызывать сопротивление и конфликт, но при этом становиться отправной точкой для изменений и выживания. «Пещерные хроники» дают представление о том, как происходили первые шаги в культурном и социальном развитии людей, включая изобретения и формирование общественных норм.