В числе трудностей, с которыми приходится столкнуться героям, — поиски еды и воды, а также взаимодействие с местной фауной, представленной паукообразными и насекомыми. Им приходится учиться распознавать, что можно есть, а что представляет опасность. Кроме того, в здании функционирует сложная автоматика, которая при этом не причиняет вреда героям. Иван пытается наладить контакт с пауками, надеясь получить помощь в ориентации или даже продовольствии.

Одной из ключевых проблем становится невозможность найти выход из здания на привычную землю и понять, где находятся те, кто построил и поддерживает этот комплекс. Герои сомневаются в своём положении, пытаются исследовать тоннели и коридоры, сталкиваются с различными техническими и биологическими явлениями, которые не поддаются простому объяснению. Неясно, с какой целью построена эта машина времени — для наблюдения, сохранения или чего-то иного.

Иван и его спутники принимают решения, связанные с изучением объекта и попытками найти другие выходы. Они следуют за звуками и видят проявления жизни, но остаются в полной неизвестности. Главный герой проявляет настойчивость и осторожность, пытается понять систему управления здания и его взаимодействие с окружающим миром. Несмотря на тревогу и неопределённость, они продолжают поиски в надежде найти ответы.

Сюжет концентрируется на испытаниях, с которыми сталкиваются герои в этом необычном месте, и на их усилиях справиться с условиями, поддерживать жизнедеятельность и попытаться связаться с внешним миром. Главная тема — взаимодействие человека с неизведанным пространством, где время и пространство переплетены, а привычные правила не действуют. Реквием машине времени показывает последовательность действий и размышлений, связанных с выживанием и исследованием в новых условиях.