Основным конфликтом становится борьба между необходимостью изучения опасного вещества и этическими и моральными вопросами, возникающими из-за использования живых существ в опытах и гибели людей от газа. Дополнительно осложняет ситуацию присутствие враждебных сил, которые участвуют в аналогичных жестоких исследованиях, поддерживаемых военными различного происхождения. Героям приходится принимать решения о том, как вести операции в таких условиях, сохраняя контроль и минимизируя потери.

Капитан Олешко и его коллеги исследуют тоннели и штреки, наполненные останками подопытных и поражёнными от газа организмами, что ставит перед ними новые вопросы о природе и воздействии этого вещества. Возникает необходимость определить, как использовать полученные данные и как предотвратить дальнейшее распространение опасного газа. В процессе работы они получают подтверждения того, что феномены красного газа и Четвёртого Царства являются угрозой для традиционного понимания жизни и неживой материи.

В конце повествования внимание концентрируется на научном осмыслении открытых фактов и попытках найти пути противодействия опасному явлению. Главная тема затрагивает границы жизни и неживой природы, а также ответственность человека за свои открытия и эксперименты. Выводы, сделанные героями, показывают необходимость осторожного подхода к новым формам существования, которые не укладываются в привычные научные рамки.