Ардашев изучает детали дела, выясняет информацию о личностях, связанных с убийством, посещает университетскую библиотеку в Одессе и находит важные сведения, которые могут помочь в раскрытии преступления. Значительную роль играют научные книги и фолианты, которые связаны с подозреваемыми лицами и содержат доказательства, раскрывающие суть преступления. Важным элементом расследования становится сопоставление текстов из разных научных изданий, что приводит к новым выводам.

Параллельно развивается история женщины по имени Фаина Кривицкая, которая оказывается вовлечённой в сложные отношения с влиятельным человеком, Галиевым. Она испытывает финансовые трудности, которые толкают её на рискованные шаги. Фаина требует у Галиева крупную сумму денег в обмен на молчание, но получает от него условие встретиться с ним в ресторане после бенефиса, чтобы получить деньги. Она опасается за свою безопасность и прячет письмо с предупреждением надежным способом. В её письме также описываются переживания и чувство унижения, вызванные изменой бывшего возлюбленного. Судебное слушание с участием Фаины происходит на фоне этой истории, что добавляет к общему накалу событий.

Главные конфликты в книге связаны с расследованием убийства, противостоянием подозреваемых и поиском правды, а также с внутренними конфликтами героев, столкнувшихся с моральными и жизненными трудностями. Клим Пантелеевич Ардашев принимает важные решения, чтобы продвинуться в расследовании, использует судебные и библиотечные ресурсы, а также обращается к помощи полиции и знакомых лиц. Он сталкивается с необходимостью разбираться в запутанных обстоятельствах и возможных обманах.

В заключительной части книги подчёркивается значимость сделанного выбора и обстоятельств, которые привели к раскрытию дела. Рассказ затрагивает темы ответственности, правосудия и последствий личных поступков. Поцелуй анаконды обращается к вопросу поиска истины и сложностям, с которыми сталкиваются люди в период перемен и конфликтов.